Sposoby zwalczania chorób i szkodników roślin wodnych różnią się od tych, które stosujemy w innych częściach ogrodu. Użycie środków chemicznych w pobliżu oczka wodnego doprowadziłoby bowiem do zatrucia wody. Jak zatem walczyć z szkodnikami i chorobami atakującymi lilie wodne?